Raíces griegas o latinas en la formación de palabras

Quisiera saber por qué en las listas de prefijos de la lengua española aparecen raíces nominales griegas o latinas, como hidro, geo, cardio, etc.,¿Es correcto incorporarlas en ellas o es preferible evaluarlas como bases de composición? Ejemplos: hidroterapia, geografía, cardiopatía. Gracias.Diana